*Code_Aster の並列化 [#pff8d5dc]

本家の情報：http://www.code-aster.org/forum2/viewtopic.php?id=14892

ダウンロードしたファイルの保存先	~/Install_Files~
インストール先		/opt と /opt/aster~
~
1. ファイルのダウンロード~
  aster-full-src-10.3.0-3.noarch.tar.gz
  acml-4-4-0-gfortran-64bit.tgz
  ParMetis-3.1.1.tar.gz
  scalapack_installer.tgz
~
2. フォルダの所有者の変更(root → user)~
 $ sudo chown username /opt/
~
3. 必要なインストール~
 $ sudo apt-get install gfortran g++ python-dev python-numpy zlib1g-dev libatlas-base-dev grace bison flex python-qt4 checkinstall mpich2
~
4. acmlのインストール~
 $ cd ~/Install_Files/
 $ mkdir ./acml
 $ cp acml-4-4-0-gfortran-64bit.tgz ./acml
 $ cd ./acml
 $ tar xfvz acml-4-4-0-gfortran-64bit.tgz
 $ ./install-acml-4-4-0-gfortran-64bit.sh -accept -installdir=/opt/acml4.4.0
 $ echo /opt/acml4.4.0/gfortran64/lib | sudo tee -a /etc/ld.so.conf.d/amd_math.conf
 $ sudo ldconfig
~
5. Code_Asterのインストール~
 $ cd ~/Install_Files
 $ tar xfvz aster-full-src-10.3.0-3.noarch.tar.gz
 $ cd aster-full-src-10.3.0/
 $ sed -i "s:PREFER_COMPILER\ =\ 'GNU':PREFER_COMPILER\ =\'GNU_without_MATH'\nMATHLIB=\ '-L/opt/acml4.4.0/gfortran64/lib -lacml':g" setup.cfg
 $ python setup.py install --prefix=/opt/aster
　（sed で書き換えた後の setup.cfg&ref(SALOME-Mecaの活用技術/setup.cfg);）~
~
6. .mpd.confの設定~
 $ cd ~/
 $ echo MPD_SECRETWORD=mr-secret > .mpd.conf
 $ chmod 600 .mpd.conf
　/opt/aster/etc/codeaster/aster-mpihosts を作成し、コンピュータ名：プロセッサー数を記入　例 ： comp1:8~
~
7. scalapackのインストール~
 $ cd ~/Install_Files
 $ tar xfvz scalapack_installer.tgz
 $ cd scalapack_installer_0.96/
 $ ./setup.py  --blaslib=/opt/acml4.4.0/gfortran64/lib/libacml.a --downblacs --lapacklib=/opt/acml4.4.0/gfortran64/lib/libacml.a --mpicc=mpicc --mpif77=mpif90 --mpiincdir=/usr/include/mpich2/ --prefix=/opt/scalapack --f90=/usr/bin/gfortran
~
8. ParMetisのインストール~
 $ cp ~/Install_Files/ParMetis-3.1.1.tar.gz /opt
 $ cd /opt
 $ tar xfvz ParMetis-3.1.1.tar.gz
 $ cd ParMetis-3.1.1
　Makefile.in に 'XTRALIBS = -lmpich' を加える~
 $ make
~
9. mumpsのインストール~
 $ cp ~/Install_Files/aster-full-src-10.3.0/SRC/mumps-4.9.2.tar.gz /opt/
 $ cd /opt
 $ tar xfvz mumps-4.9.2.tar.gz
 $ mv mumps-4.9.2 mumps-4.9.2_mpi
 $ cd mumps-4.9.2_mpi/
　Makefile.inc を添付ファイルのように書き換える&ref(SALOME-Mecaの活用技術/Makefile.inc);~
 $ make all
~
10. PAR10.3の作成~
　/opt/aster/etc/codeaster/asrun を開き、mpirun_cmd の部分を下のように書き換える~
　mpirun_cmd : mpiexec -machinefile %(mpi_hostfile)s -n %(mpi_nbcpu)s %(program)s~
 $ cd /opt/aster
 $ cp -ax STA10.3 PAR10.3
 $ cd /opt/aster/PAR10.3
　profile.sh を添付ファイルのように書き換える&ref(SALOME-Mecaの活用技術/profile.sh);~
　config.txt  を添付ファイルのように書き換える&ref(SALOME-Mecaの活用技術/config.txt);~
 $ ../bin/as_run --vers=PAR10.3 --make clean
 $ ../bin/as_run --vers=PAR10.3 --make clean bibf90/mumps
 $ mpd &
 $ ../bin/as_run --vers=PAR10.3 --make
　DIAGNOSTIC JOB : OK と表示されれば成功~
　/opt/aster/etc/codeaster/aster を開いて、 vers : STA10.3 の下に vers : PAR10.3 を追加すればASTKに PAR10.3 が登録される~
~
11. ASTK の設定~
　Options でプロセッサー数を設定~
   mpi_nbcpu＝プロセッサー数
   mpi_nbnoeud＝コンピューター数
　２台のコンピューターがそれぞれ１０個のプロセッサーを持ち、合計２０個のプロセッサーがある場合は、~
   mpi_nbcpu=20、mpi_nbnoeud=2
~
12. comm の設定~
13. 並列化の効果~
　添付のJPGか、PDFの最後の2ページを見てください。内容は同じです。&ref(SALOME-Mecaの活用技術/Parallelize_3.pdf);~
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